Druga i trzecia liga - od tego poziomu zaczął swoją pracę. Sześć sezonów sześciu US Noeux został dostrzeżony przez zarząd RC Lens.W 86 dostał awans, w którym doprowadził swoją drużynę do mistrzostw Francji. Ten sukces otworzył mu drogę znacznie większą niż planował. W 1988 obecny trener zespołu zaproponował mu, żeby został jego asystentem, wkrótce potem poddając się do dymisji. Houllier został jego następcą. Uznano go za jednego z najlepszych selekcjonerów kraju. Co prawda, jeszcze przez cztery lata był związany najpierw tymi zespołami, ale wkrótce najpierw wraz z Royem Evansem, który przez pierwszych trzynaście kolejek był jego partnerem, pracował w Liverpoolu, potem samodzielnie. Wiele razy narzekano na słabą kondycję jego grupy, jednak to właśnie dzięki niemu Reds osiągnęło najwięcej w swojej karierze. Najlepszy okres działalności było rokiem 2001, kiedy Liverpool zgarnął koronę, to znaczy wywalczył trzy największe angielskie trofea. Kiedy działał w PSG jego słaby stan zdrowotny odezwał się po raz pierwszy. Postanowił na jakiś czas odpocząć. W 2004, po kilku poważnych porażkach klubu, został zwolniony ze swojego stanowiska. To był długi czas bezrobocia Houlliera, ale na brak propozycji to narzekać nie mógł, brano go pod uwagę w najważniejszych castingach. Dopiero w 2005 zrzucił z posady Le Guena, który obejmował stanowisko szkoleniowca Olympique Lyon. Między sezonami 05 i 06 wygrał z zespołem francuskie rozgrywki ligowe.